Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1lA2A5N3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1lA2A5N3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms