Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv23A0A0A6YWQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms