Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms