Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms