Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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