Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms