Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

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Length 1,537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ercc6l2Q9JIM3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc6l2Q9JIM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6028-201ENSMUST00000077111 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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