Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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