Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms