Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Khdc3Q9CWU5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms