Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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