Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms