Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hecw1Q8K4P8 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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