Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms