Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms