Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf428Q8C1M2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms