Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms