Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms