Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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