Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms