Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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