Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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