Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Usp49Q6P9L4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Usp49Q6P9L4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Usp49Q6P9L4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp49Q6P9L4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp49Q6P9L4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp49Q6P9L4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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