Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nop58Q6DFW4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nop58Q6DFW4 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop58Q6DFW4 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop58Q6DFW4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop58Q6DFW4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop58Q6DFW4 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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