Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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