Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms