Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms