Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Znf48Q3US17 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Znf48Q3US17 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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