Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Skap2Q3UND0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms