Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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