Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms