Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms