Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms