Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc21bQ0HA38 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc21bQ0HA38 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc21bQ0HA38 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc21bQ0HA38 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc21bQ0HA38 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc21bQ0HA38 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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