Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms