Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms