Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Otx1P80205 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms