Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbdsP70122 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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