Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa8P50706 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms