Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Tmod1P49813 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms