Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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