Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb42P49222 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms