Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VdrP48281 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VdrP48281 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms