Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pax9P47242 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms