Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms