Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab20P35295 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms