Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms