Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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