Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms