Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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